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1、在临床上，肠炎的病因包括不洁食物和饮食引起的肠道菌群失调，肠道血液供应的缺血性改变，肠道菌群失调，或自身免疫性肠病，如溃疡性结肠炎和克罗恩病，或结核病。
2、即使是肠道肿瘤或息肉引起的肠梗阻，进而导致肠道菌群的变化，也会导致肠炎的症状。所以临床上肠炎症状的原因很多，需要进一步肠镜甚至CT检查才能确诊。一般确诊后，一般会给予对症治疗。
3、对于细菌性肠炎，即不洁食物和饮食引起的肠炎，通常采用抗感染治疗，缓解症状一周左右。如果是缺血性肠病引起的肠炎，通常需要改善肠道的血供，使症状得到缓解，甚至治愈。
4、如果是自身免疫性肠病引起的肠炎，通常需要长期服用美沙拉秦，并定期检查肠镜，避免溃疡或息肉恶变。另外，如果是结核病引起的，需要定期抗结核治疗。
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